清热暗疮丸需避免与抗生素类、抗凝血药、免疫抑制剂、降糖药及含重金属成分的中成药联用。

清热暗疮丸中的清热解毒成分可能降低四环素类如多西环素、大环内酯类如阿奇霉素等抗生素的生物利用度。两者联用可能影响感染治疗效果，建议间隔2小时以上服用。

该药含活血化瘀成分，与华法林、阿司匹林等抗凝药物联用可能增加出血风险。服药期间需监测凝血酶原时间，出现牙龈出血或皮下瘀斑应及时就医。

环孢素、他克莫司等药物代谢易受中药干扰。清热暗疮丸可能通过抑制肝药酶CYP3A4活性，导致免疫抑制剂血药浓度升高，增加肝肾毒性风险。

与格列本脲、二甲双胍联用可能增强降糖效果，诱发低血糖。糖尿病患者需加强血糖监测，调整降糖药剂量时应咨询内分泌科医师。

避免与朱砂安神丸、牛黄解毒片等含汞、砷成分的中成药同服，可能加重肝脏代谢负担。长期联用可能导致重金属蓄积中毒。

服用清热暗疮丸期间需保持饮食清淡，避免辛辣刺激及高脂食物影响药效；建议每日饮水量达到1500-2000毫升促进代谢；用药2周后若痤疮未改善或出现腹泻、皮疹等不良反应，应停药并就诊皮肤科。合并慢性病患者用药前需向医师提供完整用药史。