电子乙状结肠镜检查通常会有轻微不适感，但多数人可耐受。检查过程中可能出现胀气、牵拉感等不适，少数情况下可能因个体差异或操作因素产生明显痛感。
电子乙状结肠镜检查时，肠镜通过肛门进入乙状结肠的过程中会向肠腔内充气以扩张肠道，此时可能产生腹胀或压迫感。检查器械对肠壁的轻微触碰或牵拉可能引发类似痉挛的不适，但医生会通过调整进镜速度和气体量来减轻反应。多数痛感与患者紧张导致的肌肉紧绷有关，放松配合可显著降低不适程度。检查前使用的局部麻醉凝胶也能减少肛门部敏感度。
部分肠道结构异常如肠粘连、憩室炎的患者，或对疼痛阈值较低的人群，可能在肠镜通过肠道弯曲处时出现短暂锐痛。既往有腹部手术史、盆腔炎症的患者因可能存在组织粘连，痛感概率略高。若检查中发现息肉需活检或切除，器械操作可能引发类似经期腹痛的钝痛，但持续时间较短。
检查前2-3天建议低渣饮食，检查当日空腹4小时以上以减少肠道内容物干扰。检查后初期可能出现轻微腹胀，适当走动促进排气可缓解。若出现持续腹痛、便血或发热需及时就医。检查后24小时内避免驾驶或精密操作，因镇静药物可能残留影响判断力。日常增加膳食纤维摄入、保持规律排便习惯有助于降低未来检查时的不适感。
