健胃消食口服液不宜与抑酸药、抗菌药、含金属离子药物、强心苷类药物及部分中药合用，可能降低药效或增加不良反应风险。
奥美拉唑、雷尼替丁等抑酸药会升高胃内pH值，削弱健胃消食口服液中山楂、麦芽等成分的促消化作用。两类药物间隔2小时服用可减少相互作用。
四环素、左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素可能与口服液中的金属离子形成螯合物，影响抗菌效果。建议间隔3小时以上服用，避免在肠道形成不溶性复合物。
硫酸亚铁、葡萄糖酸钙等补铁补钙制剂会与口服液中的鞣质结合沉淀，降低双方生物利用度。需错开服药时间至少4小时，必要时监测血钙或血红蛋白水平。
地高辛、西地兰与口服液中的甘草成分联用可能诱发低钾血症，增加强心苷毒性风险。长期合用者需定期检测血钾浓度，必要时调整利尿剂用量。
含乌头碱的附子、川乌，或含朱砂的安神类中药与消食口服液同服可能加重胃肠道刺激。中医辨证属湿热积滞者需谨慎联用，避免寒热药性冲突。
服用健胃消食口服液期间应避免饮酒及辛辣饮食，餐后30分钟服用效果最佳。慢性胃炎患者可配合腹部按摩促进胃肠蠕动，日常建议选择山药、小米等易消化食材。若出现皮疹、腹泻等不良反应需立即停药，糖尿病患者需注意口服液中的蜂蜜成分对血糖影响。长期消化不良者建议完善胃镜检查排除器质性疾病。
