黄连具有清热燥湿、泻火解毒的功效，主要用于湿热痞满、呕吐泻痢、高热神昏、心火亢盛、目赤牙痛、痈肿疔疮等病症的治疗。
1、清热燥湿
黄连苦寒沉降，擅长清除中焦湿热，对胃肠湿热引起的脘腹胀满、恶心呕吐、泄泻痢疾有显著效果。常与木香、黄芩配伍使用，如香连丸。现代研究表明其小檗碱成分能抑制肠道病原微生物，改善肠道炎症状态。
2、泻火解毒
黄连能清泄三焦实火，尤其擅长清心胃之火。对心火亢盛所致烦躁失眠、口舌生疮，或胃火炽盛导致的牙龈肿痛效果明显。传统方剂黄连解毒汤即以黄连为主药，治疗热毒炽盛引起的疮疡肿毒。
3、抗菌消炎
黄连所含小檗碱、黄连碱等生物碱对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等革兰氏阳性菌有较强抑制作用。临床常用黄连素片治疗细菌性痢疾，外用黄连膏可处理皮肤化脓性感染。
4、调节血糖
黄连提取物能改善胰岛素抵抗，促进葡萄糖代谢。研究显示其可能通过激活AMPK通路降低血糖，常与天花粉、知母配伍用于消渴症治疗，如消渴方。
5、保肝利胆
黄连能促进胆汁分泌，减轻肝细胞损伤。对肝胆湿热型黄疸、胆囊炎有辅助治疗作用，常与栀子、茵陈配伍组成茵陈蒿汤。其抗氧化特性可减轻酒精性肝损伤。
使用黄连需注意其苦寒特性，脾胃虚寒者慎用，长期服用可能影响肠道菌群平衡。建议在中医师指导下辨证使用，避免与含鞣质的中药同服影响吸收。日常可配伍生姜、大枣缓和其寒性，治疗期间应忌食辛辣油腻，保持饮食清淡以增强药效。
