健脾消食丸不宜与含鞣质的中成药、碱性药物、抗菌药物、消化酶制剂及金属离子类药物合用。健脾消食丸主要成分为山楂、麦芽等，具有消食导滞作用，合用可能影响药效或增加不良反应风险。
健脾消食丸中的有机酸成分与鞣质结合易产生沉淀，影响药物吸收。常见含鞣质药物包括四季青片、五倍子散等，合用可能导致胃肠道不适或降低健脾消食丸的消食化积功效。两类药物建议间隔2小时以上服用。
氢氧化铝、碳酸氢钠等抗酸药会中和健脾消食丸中的酸性成分，减弱其刺激胃酸分泌的作用。消化不良患者同时存在胃酸过多时，应先咨询医生调整用药方案，避免盲目合用影响治疗效果。
四环素类、喹诺酮类抗菌药与健脾消食丸中的金属离子可能形成螯合物。诺氟沙星、左氧氟沙星等药物与山楂所含成分结合后，不仅降低抗菌效果，还可能增加胃肠道不良反应发生率。
胰酶片、多酶片等药物与健脾消食丸联用可能造成酶活性降低。两者均通过不同机制促进消化，同时使用可能导致作用重叠或相互干扰，建议根据具体消化问题选择单一治疗方案。
硫酸亚铁、葡萄糖酸钙等药物与健脾消食丸中的有机酸结合后，可能影响矿物质吸收。贫血患者补铁期间如需改善食欲，应在医生指导下错开服药时间或调整药物配伍。
服用健脾消食丸期间需注意饮食调理，避免进食油腻、生冷及刺激性食物，适当配合腹部按摩促进胃肠蠕动。慢性消化不良患者应规律进食，细嚼慢咽，餐后适度活动。若需长期联合用药或出现腹胀加重、食欲减退等情况，应及时就医评估是否存在药物相互作用或其他胃肠病变。特殊人群如孕妇、哺乳期妇女及儿童使用前应严格遵医嘱。
