促排卵药在停药并确认排卵后使用，通常不会对胎儿造成不良影响。若用药期间受孕或存在多胎妊娠风险，则可能产生不利影响。
多数情况下，促排卵药物如克罗米芬、来曲唑等在医生指导下规范使用，旨在帮助卵泡发育和排出，药物代谢较快，通常在排卵前或排卵时已大部分代谢完毕，此时受孕形成的胚胎一般不受药物残留影响，胎儿发育概率与自然受孕相近。临床数据显示，规范用药后的单胎妊娠结局良好，新生儿畸形率未显示出明显升高趋势。患者只需遵医嘱监测卵泡发育情况，在确认优势卵泡排出后安排同房或人工授精，即可有效规避药物对胚胎的潜在干扰，无需过度焦虑药物致畸问题。
少数特殊情况包括在药物尚未完全代谢时发生受精，或者因药物反应导致多卵同时排出引发多胎妊娠。多胎妊娠属于高危妊娠范畴，易导致早产、低出生体重儿、妊娠期高血压等并发症，间接影响胎儿健康。此外，若患者本身存在卵巢过度刺激综合征风险，强行促排可能导致母体环境恶化，进而影响胚胎着床和早期发育。极个别情况下，若未严格掌握适应证而滥用药物，可能干扰内分泌平衡，增加流产或胎儿发育异常的概率，但这多见于非正规医疗行为。
备孕女性在使用促排卵药物期间应严格遵循生殖专科医生的诊疗方案，定期进行超声监测和激素水平检测，切勿自行购药服用。一旦确认怀孕，应及时告知医生用药史以便评估风险。日常生活中需保持规律作息，避免熬夜和过度劳累，均衡摄入富含优质蛋白、维生素C和膳食纤维的食物，如鸡蛋、牛奶、西蓝花、苹果等，以增强体质。同时要保持心态平和，避免精神紧张影响内分泌，如有腹痛或阴道流血等不适症状须立即就医。
