怀孕前三个月吃避孕药对胎儿可能产生一定影响，具体影响取决于服药时的孕周及药物种类，在受精后两周内服用影响较小或导致自然流产，在受精两周后服用则可能增加胎儿发育异常的风险。
如果在受精后两周内服用了避孕药，此时胚胎细胞尚未分化，遵循全或无理论，药物要么导致早期自然流产被身体排出，要么对胚胎无明显影响，后续胎儿可正常发育。例如左炔诺孕酮紧急避孕药在该阶段服用，一般不会造成结构畸形，但需注意后续产检排除其他因素。而如果在受精两周后，即孕5周到12周之间服用了避孕药，此时胚胎器官开始分化，药物的激素成分可能干扰胎儿生殖系统、神经管等发育，增加先天性心脏病、尿道下裂等畸形的概率，短效避孕药中的雌激素和孕激素也可能影响胎儿内分泌。此外，不同避孕药成分不同，米非司酮抗孕激素作用可能对妊娠维持产生更严重的不良反应。
如果在受精后两周内服用了避孕药，虽然全或无理论下胎儿可能不受影响，但仍建议及时就医进行血HCG和超声检查确认胚胎存活情况，同时补充叶酸预防神经管缺陷。整个孕期应遵医嘱完成唐氏筛查、大排畸等系统检查，尤其关注胎儿心脏和泌尿系统。日常注意避免接触其他有害物质，保持均衡饮食和适度活动，如果出现阴道流血或腹痛需立即就医排查流产迹象。
