中药灌肠可能对肠道菌群、肠黏膜及全身代谢产生影响，具体效果与操作规范、药物成分及个体差异有关。中药灌肠主要有调节肠道功能、促进毒素排出、缓解局部症状等作用，但也存在肠道黏膜刺激、电解质紊乱等风险。
一、调节肠道功能
中药灌肠可通过药物直接作用于结肠，刺激肠壁神经丛，增强肠道蠕动，改善便秘或腹泻症状。例如含大黄、枳实等成分的方剂能促进排便，而五倍子、诃子等具有收敛作用的药物可缓解慢性腹泻。操作时需控制药液温度在37-40摄氏度，避免冷刺激导致肠痉挛。
二、促进毒素排出
部分清热解毒类中药如蒲公英、败酱草通过肠黏膜吸收后，可帮助清除体内代谢废物。灌肠时药物经结肠黏膜吸收进入门静脉系统，能部分替代肝脏解毒功能，对慢性肝病患者可能有一定辅助作用。但长期使用可能干扰肠道正常排泄机制。
三、缓解局部症状
针对溃疡性结肠炎等疾病，白头翁汤等灌肠可减轻肠黏膜充血水肿。药物直接接触病变部位，能快速抑制局部免疫反应，缓解里急后重、黏液脓血便等症状。需注意灌肠导管插入深度不超过15厘米，避免损伤直肠黏膜。
四、肠道黏膜刺激
部分含挥发性成分或刺激性药材可能引发肠黏膜充血，表现为灌肠后腹痛加重。如使用含冰片、樟脑的方剂时，药物浓度过高会导致肠壁血管扩张，严重时可引起黏膜糜烂。初次灌肠建议从低浓度开始，观察耐受性后再调整。
五、电解质紊乱风险
频繁灌肠可能破坏肠道水电解质平衡，尤其是含芒硝等泻下药的方剂。大量液体灌注会加速钠钾离子流失，出现乏力、心律失常等低钾血症表现。老年人及心肾功能不全者应严格控制灌肠频率，每周不超过2次为宜。
进行中药灌肠前需由中医师辨证选方，避免自行配伍药物。灌肠后2小时内保持卧位以促进药物吸收，饮食宜选择易消化的粥类、蒸煮蔬菜，避免辛辣刺激食物。出现持续腹痛、便血或发热应立即停止灌肠并就医。治疗期间建议记录排便情况及身体反应，便于医生调整方案。慢性病患者灌肠需与口服药物间隔2小时以上，防止药物相互作用。
