HPV用药期间一般不建议同房。HPV感染期间同房可能影响药物效果，还可能增加病毒传播风险。
HPV感染期间生殖道黏膜可能存在微小创面或炎症反应，同房时的机械摩擦可能加重局部刺激，导致用药部位不适或出血。部分外用药物如干扰素栓、保妇康栓等需在阴道内保留一定时间，同房可能造成药物过早脱落，降低局部药物浓度。此外即使使用避孕套也无法完全阻断病毒传播，尤其当疣体存在于避孕套未覆盖区域时。
若必须同房需严格采取安全措施，使用避孕套可减少病毒暴露风险。需避开用药后2小时内及治疗创面未愈合阶段，动作应轻柔避免造成黏膜损伤。合并尖锐湿疣者应禁止同房直至疣体完全消退，防止病毒通过皮损传播。
建议完成整个疗程后再恢复同房，治疗期间保持外阴清洁干燥，避免使用刺激性洗液。配偶或性伴侣应同步进行HPV筛查，阳性者需共同治疗。定期复查HPV分型检测，转阴后仍建议使用避孕套防护3-6个月。出现异常出血或分泌物增多应及时就医。
