甲减多数情况下需要终身服药，少数由暂时性因素引起的甲减可能无须长期用药。甲状腺功能减退症的处理主要取决于病因，常见情况包括自身免疫损伤、甲状腺手术后、放射性碘治疗后、药物影响以及暂时性炎症。
绝大多数甲减患者是因为自身免疫性甲状腺炎导致甲状腺组织被不可逆地破坏，或者是接受了甲状腺全切手术、放射性碘治疗，这些情况下的甲状腺功能丧失是永久性的，无法自行恢复，因此必须终身补充外源性甲状腺激素来维持正常的生理代谢，一旦停药会导致症状复发甚至出现黏液性水肿昏迷等严重后果。另外一部分患者是因为服用某些特定药物或处于亚急性甲状腺炎的恢复期而出现的暂时性甲状腺功能低下，随着原发病的好转或药物的停用，甲状腺功能有可能逐渐恢复正常，这类人群在医生严密监测下可以尝试减量直至停药，但这种情况在临床总体甲减人群中占比较少，大部分确诊为原发性甲减的成年患者都需要做好长期甚至终身服药的心理准备和治疗规划，切勿擅自中断治疗以免引起病情波动。
甲减患者在日常生活中应保持规律作息，避免过度劳累和情绪剧烈波动，饮食上需注意适量摄入含碘食物，既不可盲目忌碘也不宜过量补碘，同时应定期复查甲状腺功能指标，严格遵医嘱调整药物剂量，确保体内激素水平维持在正常范围，如有心慌、手抖或乏力加重等不适症状应及时就医咨询。
