怀孕期间一般不建议自行服用黄连上清丸。若需用药应严格遵医嘱，避免对胎儿发育造成潜在影响。
黄连上清丸含有黄连、黄芩等苦寒成分，具有清热泻火功效。孕期女性体质特殊，苦寒药物可能刺激胃肠黏膜，引发腹痛腹泻，严重时可能诱发子宫收缩。部分成分如大黄含蒽醌类物质，长期使用可能影响胎儿营养吸收。中成药复方制剂成分复杂，目前缺乏足够临床数据证实其对妊娠的安全性。
少数特殊情况如孕妇出现实热火毒证候，经中医师辨证后可能短期小剂量使用。但需排除先兆流产、胎盘低置等禁忌证，并配合保胎措施。临床更倾向选择金银花露等安全性更明确的替代方案。
孕期出现上火症状建议优先通过饮食调节，适量食用梨、莲藕等凉性食物，每日饮水不少于1500毫升。保持规律作息，避免熬夜及情绪波动。若症状持续或加重，应及时到产科和中医科联合门诊就诊，不可自行用药。注意监测胎动变化，孕早期及孕晚期尤其需要谨慎。
