药物治疗包括降压药及针对合并症的药物应用。降压药的应用首先要把握好适应症，包括有症状的高血压，继发性高血压，合并糖尿病、心血管损害的高血压及非药物疗法效果差的等。儿童常用降压药种类有血管紧张素转化酶抑制剂、血管紧张素Ⅱ受体阻断剂、β受体阻滞剂和利尿剂等。开始治疗时先用一种药物，由最小剂量开始，逐渐增大剂量直至血压控制满意的剂量，如果已达较大治疗量仍不满意，方可增加另一种药物，如ACEI类与利尿剂，或钙拮抗剂与利尿剂合用。
非药物治疗是基础治疗手段，其要点主要是养成良好的生活方式及克服不良生活习惯，如肥胖儿童要注意节制饮食，增加活动和体育锻炼，以达到降低或控制体重的目的。在饮食中控制食盐的摄入。当家庭中有高血压患儿时，烹饪时务必少放盐、要少吃腌制和炸烤食品、保持饮食清淡、增加水果蔬菜的摄入量。还要注意限制孩子每天看电视、玩电脑的时间，不宜超过2小时。鼓励孩子多活动，减少静息状态。如果非药物疗法能使血压降低并稳定在120/80mmHg以内，无需药物治疗。
