儿童肥胖症建议首诊儿科或内分泌科。儿童肥胖涉及生长发育异常和代谢紊乱，专业分诊可提高诊疗效率。
儿科是处理儿童健康问题的综合科室，能对肥胖进行基础评估和初步筛查。医生会测量身高体重计算BMI百分位数，排查是否存在单纯性肥胖。若伴随生长迟缓、性发育异常或血糖血脂异常，可能转诊至内分泌科进一步诊治。
内分泌科专门处理激素代谢相关疾病，适合评估肥胖合并代谢综合征的情况。常见检查包括甲状腺功能、胰岛素抵抗检测、皮质醇节律等，用于鉴别库欣综合征、甲状腺功能减退等内分泌性肥胖。部分三甲医院设有儿童内分泌亚专科，对青春期肥胖合并多囊卵巢综合征等疾病更具针对性。
少数情况下需联合其他科室。如怀疑遗传性疾病普拉德-威利综合征需遗传代谢科介入；合并严重睡眠呼吸暂停需耳鼻喉科或呼吸科会诊；骨科参与评估肥胖相关关节损伤。
就诊前建议记录孩子的饮食运动日记、生长发育曲线图、既往体检报告等资料。多数儿童肥胖通过生活方式干预即可改善，但需先排除病理性因素再制定个性化方案。
