盐酸氨基葡萄糖胶囊和硫酸氨基葡萄糖胶囊的主要区别在于所含氨基葡萄糖的酸根形式不同，两者在适应症和疗效上无显著差异，但可能存在个体化吸收差异。
盐酸氨基葡萄糖胶囊含有氨基葡萄糖盐酸盐，其氨基葡萄糖含量较高，每粒胶囊中有效成分浓度通常约为98%，部分患者可能因盐酸根的存在而胃肠刺激稍明显。硫酸氨基葡萄糖胶囊则以氨基葡萄糖硫酸盐形式存在，由于硫酸根易与氯化钠结合，部分产品会添加氯化钠作为稳定剂，因此对钠摄入敏感者需谨慎。两者的药理作用机制相同，均通过补充关节软骨基质成分，刺激软骨细胞生成蛋白多糖，抑制炎性介质释放，从而改善骨关节炎引起的疼痛和功能障碍。临床研究显示两种制剂在缓解轻中度膝骨关节炎症状方面疗效相近，但硫酸氨基葡萄糖的生物利用度可能略高。
盐酸氨基葡萄糖在储存过程中稳定性较强，而硫酸氨基葡萄糖可能因潮解性需要更严格的保存条件。对于合并高血压或需限制钠摄入的患者，建议优先选择无钠配方的硫酸氨基葡萄糖或盐酸氨基葡萄糖。两类药物均需连续服用4-12周才能显现治疗效果，用药期间可能出现轻度恶心、腹胀等不良反应，长期使用需监测肝功能。
选择时可考虑个体耐受性和合并症情况，骨关节炎患者应配合体重管理、关节保暖及低冲击运动等综合干预。出现持续关节肿胀或活动受限时应及时复查，避免自行延长用药周期超过3个月。
