荠菜具有药用价值，传统医学认为其主治痢疾、水肿、目赤肿痛等疾病，现代研究显示其提取物对高血压、糖尿病有一定辅助调节作用。
1、痢疾
荠菜含有的荠菜酸、胆碱等成分能抑制肠道致病菌，缓解细菌性痢疾引起的腹痛腹泻。传统用法为鲜品捣汁或煎汤服用，可配合马齿苋、黄连等药材增强疗效。需注意严重痢疾患者应及时就医，避免脱水。
2、水肿
荠菜中的钾离子和胆碱成分具有利尿作用，对心源性或肾源性轻度水肿有缓解效果。常与玉米须、茯苓配伍使用。但肾功能不全者应控制摄入量，每日食用鲜品不宜超过100克。
3、目赤肿痛
荠菜叶汁外敷可缓解结膜炎引起的眼睑红肿，其维生素A和抗氧化物质能减轻炎症反应。使用时需煮沸冷却后以无菌棉签蘸取涂抹，合并细菌感染时需联用左氧氟沙星滴眼液等药物。
4、高血压辅助
荠菜中的乙酰胆碱和膳食纤维有助于血管扩张，对原发性高血压患者可能产生轻度降压效果。建议每周食用2-3次荠菜粥，避免与降压药同服以免协同作用导致低血压。
5、血糖调节
荠菜多糖可能通过抑制α-葡萄糖苷酶活性延缓糖分吸收，动物实验显示其提取物可使餐后血糖上升幅度降低。糖尿病患者可适量凉拌食用，但不可替代降糖药物。
食用荠菜前需充分焯水去除草酸，脾胃虚寒者应配伍生姜烹调。作为药食同源植物，其治疗作用有限，出现持续发热、血便、视力模糊等严重症状时须立即就医。建议高血压、糖尿病患者定期监测指标，在医生指导下将荠菜作为膳食补充而非主要治疗手段。
