一般情况下，连花清瘟胶囊和小柴胡颗粒可以在同一天内吃，基本不会对身体健康造成不良影响，建议患者遵医嘱服用药物。具体分析如下：
连花清瘟胶囊由连翘、金银花、炙麻黄、炒苦杏仁、石膏等成分组成，有清瘟解毒、宣肺泄热的作用，可用于治疗流行性感冒引起的肌肉酸痛、鼻塞、头痛等症状，对于普通感冒引起的发热、咳嗽有一定的治疗效果。而小柴胡颗粒的主要成分有柴胡、甘草、人参、黄芩、半夏等，有解表散热，疏理肝气的功效。两种药物在成分上既不冲突也不重复，在药效上也基本不会相互作用，若出现药物的适应症，患者可以在医生的指导下在同一天之内服用这两种药物，一般有比较好的治疗效果，通常不会对身体健康带来不良影响。
患者在服药期间需要注意清淡饮食，若症状未及时缓解，建议及时就医治疗。
