保济丸可通过促进消化、缓解腹胀、调节肠道菌群、改善食欲、减轻轻微腹泻等方式调节肠胃功能。其作用机制与陈皮、木香等中药成分促进胃肠蠕动、苍术厚朴化湿行气有关。

保济丸含有的山楂、神曲等成分能刺激胃酸分泌，加速食物分解。对于进食过量或油腻饮食后的胃胀不适，餐后服用可帮助缓解饱胀感。需注意避免与抑酸药物同服。

方中木香、枳壳具有理气消胀功效，能改善因肠道积气导致的腹部膨隆。适合功能性消化不良人群，但持续腹胀超过3天需排查肠梗阻等器质性疾病。

广藿香、苍术等芳香化湿成分可抑制有害菌过度繁殖，对旅行者腹泻或抗生素相关肠道菌群失调有一定辅助作用。建议配合酸奶等益生菌食物增强效果。

佩兰、薄荷的醒脾开胃作用能改善食欲不振，尤其适用于夏季暑湿困脾导致的纳差。儿童用量需减半，连续服用不超过1周。

对于受凉或饮食不当引发的非感染性轻度腹泻，保济丸中茯苓、泽泻的利水渗湿作用可减少排便次数。伴随发热或脓血便时应立即停用并就医。

日常可配合小米粥、山药等健脾食物增强调理效果，避免生冷辛辣刺激。急性胃肠炎发作期或慢性肠道疾病患者需在医师指导下使用，服药期间出现皮疹、心悸等不良反应需及时停药。适度进行八段锦、腹部按摩等温和运动有助于协同改善胃肠功能。