通常情况下，会厌囊肿和咽喉炎可能是有关系的。具体分析如下：
会厌囊肿是指在会厌后壁上形成的液体或囊状结构，一般是喉部先天性发育畸形、感染等引起。会厌囊肿通常是没有症状的，大多数情况下不需要进行特殊治疗。但如果囊肿变大或者在囊肿内部发生感染，可能会引起咽喉症状，如咳嗽、喉咙痛、吞咽困难等，此时可能需要及时就医，在医生指导下进行药物治疗，必要时进行手术治疗。咽喉炎是发生于咽喉的炎症，一般是病毒或细菌感染引起，但也可能是声音过大、吸烟等原因所致，容易出现喉咙痛、嗓音嘶哑、干咳等症状。尽管会厌囊肿本身并不是引起咽喉炎的常见原因，但如果囊肿发生感染，可能会引起咽喉炎。
功能主治：阿莫西林适用于敏感菌（不产β内酰胺酶菌株）所致的下列感染：
1.溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染。
2.大肠埃希菌、奇异变形杆菌或粪肠球菌所致的泌尿生殖道感染。
3.溶血链球菌、葡萄球菌或大肠埃希菌所致的皮肤软组织感染。
4.溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致急性支气管炎、肺炎等下呼吸道感染。
5.急性单纯性淋病。
6.本品尚可用于治疗伤寒、伤寒带菌者及钩端螺旋体病；阿莫西林亦可与克拉霉素、兰索拉唑三联用药根除胃、十二指肠幽门螺杆菌，降低消化道溃疡复发率。
用法用量：1.成年人一次0.5g，每6～8小时1次，一日剂量不超过4g；2.小儿一日剂量按体重20～40mg/Kg，每8小时1次；3个月以下婴儿一日剂量按体重30mg/Kg，每12小时1次；3.肾功能严重损害患者需调整给药剂量，其中内生肌酐清除率为10～30ml/分钟的患者每12小时0.25～0.5g；内生肌酐清除率小于10ml/分钟的患者每24小时0.25～0.5g。
如果出现不适，建议及时就医。患者可以在医生指导下使用复方金银花颗粒、阿莫西林胶囊等药物进行治疗。服药期间，建议饮食清淡，避免摄入辣椒、火锅、浓茶等辛辣、刺激的食物。
