二陈合剂适用于痰湿蕴肺引起的咳嗽痰多、胸脘胀闷等症状，儿童、成人均可在医生指导下使用，但过敏体质者、孕妇禁用。
二陈合剂主要用于治疗痰湿壅滞导致的咳嗽，表现为痰液黏稠量多、色白易咳，伴有胸闷、食欲减退等症状。其组方中的半夏、陈皮具有燥湿化痰作用，茯苓能健脾利湿，甘草调和诸药，共同改善痰湿阻肺引起的呼吸道不适。若痰液转为黄稠或伴有发热，需警惕细菌感染，此时不宜单独使用该药。
对于慢性支气管炎非急性发作阶段，当出现痰湿症状时可在医生指导下配合使用。该药能帮助减少气道分泌物，缓解咳嗽症状，但需注意合并细菌感染时须联用抗生素。用药期间应避免生冷油腻食物，观察是否出现口干、便秘等不良反应。
部分胃肠型感冒伴随恶心呕吐、脘腹胀满伴咳嗽痰多时，二陈合剂中的陈皮、半夏可发挥和胃止呕功效。但需与藿香正气类制剂区别，后者更适用于外感风寒内伤湿滞引起的腹泻症状。若呕吐剧烈或持续发热，应及时就医排除急性胃肠炎。
中医辨证属于脾虚湿盛体质的人群，可能出现舌苔厚腻、肢体困重伴随咳痰症状时，可短期使用辅助调理。但需配合饮食控制，减少肥甘厚味摄入，长期调理应以健脾化湿为主，不宜依赖该药作为减肥手段，避免过量使用损伤脾胃阳气。
全麻术后患者出现痰液排出困难时，在排除感染情况下可短期使用促进排痰。但必须由医生评估后使用，尤其心血管术后患者需警惕药物中的陈皮可能影响华法林等抗凝药代谢。配合叩背排痰等物理疗法效果更佳，用药不超过3天无效需复诊。
使用二陈合剂期间需忌食辛辣刺激及生冷食物，保持饮食清淡。儿童用药需严格遵医嘱调整剂量，服药3天症状未缓解或出现皮疹、呼吸困难等过敏反应应立即停药就医。慢性病患者用药前应告知医生正在使用的其他药物，避免药物相互作用。痰液带血或伴有喘促时应及时完善胸部CT等检查，排除肺炎、肺结核等严重疾病。
