直肠炎通常需要通过肠镜检查、粪便检测、血液检查等方式确诊。直肠炎的诊断主要与炎症程度、病因类型等因素相关，具体检查项目需结合临床表现由医生综合判断。
肠镜检查是诊断直肠炎的核心手段，可直接观察直肠黏膜充血、水肿、糜烂等病变特征，必要时可钳取组织进行病理活检。慢性直肠炎患者可能出现黏膜血管纹理模糊、颗粒样改变等典型表现。
粪便检测包括常规检查和培养检查，可排查细菌性痢疾、阿米巴感染等病原体。隐血试验阳性提示黏膜出血，白细胞计数升高反映肠道炎症活动度。部分患者需进行艰难梭菌毒素检测以鉴别伪膜性肠炎。
血液检查主要评估炎症指标和营养状况。C反应蛋白和血沉升高提示急性炎症反应，贫血可能由长期慢性失血导致。血清白蛋白降低常见于重度炎症性肠病合并营养不良者。
影像学检查如腹部CT或MRI适用于并发症筛查，可发现肠壁增厚、脓肿形成等异常。钡剂灌肠造影目前已较少使用，但在某些医疗资源受限地区仍作为辅助诊断方式。
少数情况下需进行免疫学检查，如抗中性粒细胞胞浆抗体检测有助于溃疡性结肠炎的鉴别诊断。对于反复发作或治疗效果不佳的患者，建议完善甲状腺功能、乳糜泻相关抗体等排查全身性疾病。
