苍耳主治风寒头痛、鼻渊流涕、风湿痹痛、皮肤瘙痒等疾病，需遵医嘱使用。
1、风寒头痛
苍耳具有发散风寒的功效，适用于外感风寒引起的头痛症状。其辛温之性可驱散头面部寒邪，缓解头部紧束感、胀痛等不适。临床常与防风、白芷等配伍使用，但需注意阴虚血亏者慎用。
2、鼻渊流涕
对于慢性鼻炎、鼻窦炎导致的鼻塞流涕，苍耳能通鼻窍、化湿浊。所含挥发油成分可减轻鼻腔黏膜水肿，改善通气功能。多与辛夷、薄荷等同用，但过敏性鼻炎急性发作期不宜单独使用。
3、风湿痹痛
苍耳可祛风除湿，缓解关节肌肉酸痛。对风湿性关节炎、类风湿关节炎引起的晨僵、关节肿胀有一定改善作用。常配伍羌活、独活等药材，但关节红肿热痛属热痹者禁用。
4、皮肤瘙痒
苍耳外用可治疗湿疹、荨麻疹等皮肤疾患。其抗炎止痒作用能缓解丘疹、风团伴发的瘙痒症状。多煎汤外洗或配伍地肤子、白鲜皮等，皮肤破损处需避免使用。
5、其他应用
部分地区将苍耳用于疟疾、痢疾等病症，现代研究显示其含有具抗菌活性的苍耳苷等成分。但因毒性较大，此类用法已逐渐被更安全的药物替代，不建议自行尝试。
使用苍耳期间应忌食辛辣刺激食物，避免加重热性症状。风湿患者可配合适度关节活动，但需避免剧烈运动。鼻腔用药前建议用生理盐水清洗，皮肤外用需先小范围测试过敏反应。出现恶心、呕吐等中毒症状应立即停药就医，孕妇及肝肾功能不全者禁用。
