口炎颗粒与部分药物存在相互作用风险，需避免联合使用。常见禁忌合用的药物主要有阿司匹林、华法林、甲氨蝶呤三类。
阿司匹林等非甾体抗炎药可能加重口炎颗粒中清热解毒成分对胃肠黏膜的刺激，增加消化道出血风险。华法林等抗凝药物与口炎颗粒联用可能影响凝血功能，导致国际标准化比值异常波动。甲氨蝶呤等免疫抑制剂与口炎颗粒联用可能干扰药物代谢，增加肝肾负担。
部分中成药如牛黄解毒片、六神丸等含相似功效成分，联合使用可能导致成分过量。含金属离子的制剂如铝碳酸镁、硫酸亚铁可能影响口炎颗粒中黄芩苷等成分的吸收效率。
特殊人群需特别注意：糖尿病患者合用降糖药时需监测血糖，高血压患者合用降压药时需观察血压波动。药物相互作用存在个体差异，使用前建议向医师或药师咨询完整的用药史。
