事后紧急避孕药的副作用通常较小且短暂，多数女性可以耐受，但不同个体反应存在差异。其副作用主要与药物成分（如左炔诺孕酮、米非司酮等）有关，常见表现包括恶心呕吐、月经紊乱、不规则阴道出血、头痛头晕等。
大多数情况下，服用紧急避孕药后出现的副作用是轻微且一过性的。恶心呕吐是最常见的反应，通常在服药后几小时内出现，一般持续不超过24小时，若在服药后2小时内发生呕吐，可能需要补服一次。月经紊乱也较为常见，可能导致下次月经提前或推迟，或出现点滴状的不规则出血，这主要是因为高剂量激素干扰了正常的子宫内膜周期。头痛、头晕、乳房胀痛、乏力等症状也可能出现，但通常程度较轻，休息后可缓解。这些反应一般不需要特殊处理，身体会在1-2个周期内自行恢复正常。
少数情况下，部分女性可能会出现较为明显的副作用或罕见情况。例如，少数人可能出现严重的恶心呕吐，影响药物吸收；月经推迟超过7天，需要警惕怀孕的可能；极少数情况下可能出现下腹部剧烈疼痛，需排除异位妊娠的风险。对于有偏头痛病史的女性，服用后可能诱发或加重头痛。此外，如果在一个月经周期内多次服用紧急避孕药，会显著增加月经紊乱和内分泌失调的概率。若出现严重不适或月经长时间不恢复，建议及时就医检查。
建议仅在无保护性生活后作为紧急补救措施使用，不宜作为常规避孕手段。服药后应适当休息，饮食上选择清淡易消化的食物，如米粥、面条等，避免辛辣刺激和油腻食物以减轻胃肠不适。同时注意观察下一次月经情况，若月经推迟超过一周，应进行早孕检测。为减少副作用，可尝试在饭后服用以减轻恶心感。日常应选择更稳定可靠的避孕方式，如短效口服避孕药、避孕套或宫内节育器，以保护生殖健康。
