肾蕨主治风湿痹痛、跌打损伤、痢疾、淋证、乳痈等疾病，需遵医嘱使用。
1、风湿痹痛
肾蕨具有祛风除湿的功效，其根茎含有的黄酮类成分可抑制炎症因子释放，缓解关节肿胀疼痛。对于类风湿性关节炎、骨关节炎等疾病引起的晨僵、活动受限症状有一定改善作用。常与威灵仙、独活等药材配伍使用，但脾胃虚寒者慎用。
2、跌打损伤
肾蕨能活血散瘀，其乙醇提取物可促进局部血液循环，加速淤血吸收。适用于扭挫伤、软组织损伤初期出现的红肿热痛，可捣碎外敷或配伍红花、当归等内服。开放性伤口及孕妇禁用。
3、痢疾
肾蕨煎剂对志贺氏菌、伤寒杆菌等肠道致病菌有抑制作用，可用于湿热型痢疾伴里急后重、脓血便等症状。常与黄连、马齿苋同用，但虚寒型痢疾患者不宜单独使用。
4、淋证
肾蕨通过利尿通淋作用改善泌尿系统感染，对膀胱湿热引起的小便涩痛、尿频急有效。现代研究显示其多糖成分能抑制大肠杆菌对尿路上皮的黏附，常与车前草、瞿麦配伍。
5、乳痈
肾蕨清热解毒的特性适用于急性乳腺炎初期，可缓解乳房胀痛、局部发红发热。鲜品捣烂外敷或配合蒲公英、金银花煎服，但已化脓者需及时就医。
使用肾蕨期间应避免辛辣刺激食物，阳虚体质者长期服用可能加重畏寒症状。治疗风湿性疾病时可配合适度关节活动，但急性期应减少负重。泌尿系统感染患者需每日饮水超过2000毫升，保持会阴清洁。哺乳期乳腺炎患者除用药外，应定时排空乳汁并采用冷敷缓解肿胀。所有适应证均需经中医辨证后使用，不可自行加大剂量或延长疗程。
