原发性胆汁性肝硬化现称原发性胆汁性胆管炎，PBC的诊断需结合临床表现、实验室检查及影像学特征综合判断。诊断标准主要包括血清抗线粒体抗体阳性、碱性磷酸酶升高持续6个月以上，并排除其他胆汁淤积性疾病。
抗线粒体抗体AMA阳性是PBC最具特异性的血清学标志，阳性率可达95%，尤其是M2亚型。肝功能检查中碱性磷酸酶ALP和γ-谷氨酰转移酶GGT显著升高，常伴有总胆固醇升高。约50%患者早期出现IgM水平增高。
病理学检查并非诊断必需，但肝活检可见特征性非化脓性破坏性胆管炎及胆管消失现象，组织学分期分为胆管炎期、胆管增生期、瘢痕期和肝硬化期。影像学检查主要用于排除胆道梗阻，超声、MRCP显示肝内胆管无扩张。
需鉴别的疾病包括药物性肝损伤、原发性硬化性胆管炎、胆管癌等。合并干燥综合征、甲状腺疾病等自身免疫性疾病时支持诊断。2018年EASL指南强调，AMA阴性但符合其他标准者需肝活检确诊。
疾病分期依据Mayo风险评分或巴黎标准，评估指标包含胆红素、白蛋白、凝血酶原时间及水肿情况。早期诊断对熊去氧胆酸治疗反应良好，可显著延缓肝纤维化进展。
