短效避孕药的危害通常较小且可控，主要表现为恶心、头痛、乳房胀痛等早期不适，以及增加血栓风险等罕见但需警惕的严重问题。短效避孕药主要通过抑制排卵来达到避孕效果，其安全性较高，但并非完全没有风险。
短效避孕药最常见的危害是服药初期出现的类早孕反应，如恶心、呕吐、头晕和乏力，这些症状通常在服药1-3个月后逐渐减轻或消失。部分女性可能出现不规则阴道出血，即突破性出血，这多发生在服药的前几个周期，随着身体适应会自行改善。少数使用者会经历情绪波动、抑郁或性欲减退，这与药物对激素水平的调节有关。体重变化也是常见顾虑，部分女性因水钠潴留而感觉体重增加，但通常不超过2-3公斤。长期使用短效避孕药可能增加静脉血栓栓塞的风险，尤其是吸烟、肥胖或年龄超过35岁的女性，风险会进一步升高。此外，极少数情况下可能影响肝功能，导致肝酶升高，但停药后多可恢复。对于有偏头痛病史的女性，服药可能加重头痛症状或增加缺血性卒中风险。短效避孕药还可能影响体内维生素B6、叶酸等营养素的代谢，长期服用者需注意补充。需要明确的是，短效避孕药并不增加总体癌症风险，反而能降低卵巢癌和子宫内膜癌的发生概率，但对乳腺癌的影响存在争议，部分研究提示可能有轻微风险升高。
建议在服用短效避孕药前咨询医生，评估自身健康状况，特别是是否有血栓病史、肝脏疾病或乳腺癌家族史。服药期间应定期监测血压和体重，若出现严重头痛、胸痛、呼吸困难或腿部肿胀疼痛等症状，需立即就医。日常注意均衡饮食，适当补充维生素B族，戒烟限酒，避免长时间静坐，以降低血栓风险。停药后若计划怀孕，通常建议等待1-3个月经周期，让身体恢复自然激素平衡。
