华佗再造丸主要用于治疗缺血性中风引起的偏瘫、肢体麻木以及口眼歪斜等症状，也可用于风寒湿痹导致的关节疼痛、屈伸不利。其主要功能为活血化瘀、祛风通络、舒筋止痛。
华佗再造丸对脑血栓或脑梗塞导致的半身不遂有明显改善作用，其含有的川芎、红花等成分能促进脑部血液循环，减轻因缺血造成的神经功能损伤。患者在医生指导下使用时需配合康复训练，常见伴随症状包括语言障碍、吞咽困难等。需注意与阿司匹林肠溶片、胞磷胆碱钠片等西药联合使用时须间隔2小时以上。
对于风湿侵袭引起的关节肿痛、晨僵症状，该药可通过祛风除湿缓解疼痛。其含有的独活、秦艽等药材具有抗炎镇痛作用，适用于阴雨天加重的寒湿型关节病。使用期间应避免与双氯芬酸钠缓释片、洛索洛芬钠片等非甾体抗炎药同时服用，防止胃肠道刺激。
糖尿病或外伤导致的末梢神经损伤出现手足麻木时，药物中的地龙、全蝎等虫类成分能通络止痉。临床常与甲钴胺片、维生素B1片等营养神经药物协同治疗，典型表现为蚁行感、刺痛等异常感觉。服药期间需监测血糖水平以防药物相互作用。
急性面瘫患者出现口角下垂、闭眼困难时，该药可通过改善局部微循环促进神经恢复。需配合针灸治疗增强疗效，常见诱因包括病毒感染、受凉等。与更昔洛韦胶囊联用时需遵医嘱调整剂量，禁用期间避免冷风直吹患侧。
颈椎退变压迫血管引发的眩晕、头痛症状，药物中的天麻、钩藤可平肝熄风。临床验证其能减少椎基底动脉供血不足发作频率，常伴随颈部僵硬、视觉模糊等症状。建议与颈复康颗粒交替使用，治疗期间需保持正确坐姿避免长时间低头。
使用华佗再造丸需严格遵循中医辨证，实热证或肝阳上亢型中风患者禁用。服药期间忌食生冷油腻，避免与抗凝血药物同服。建议连续服用不超过3个月，若出现皮肤瘙痒或转氨酶升高应及时停药。慢性病患者需定期复查肝肾功能，配合适度活动如八段锦锻炼可增强疗效。
