皮肤破损、碘过敏、甲状腺疾病急性期等情况不适合使用碘酊。碘酊的使用禁忌主要有黏膜部位禁用、婴幼儿慎用、妊娠期避免大面积使用、合并肾功能不全者需谨慎、对金属制品有腐蚀性等。
开放性伤口或大面积皮肤溃烂时禁用碘酊。碘酊的刺激性可能延缓伤口愈合，其高浓度酒精成分会引发剧烈疼痛。此时建议改用生理盐水冲洗或医用无菌敷料覆盖，必要时可选用苯扎氯铵等温和消毒剂。
对碘制剂过敏者接触后可能出现皮肤红斑、瘙痒甚至过敏性休克。使用前应询问过敏史，疑似过敏体质者可先在前臂内侧小面积试用。出现过敏反应需立即停用并用清水冲洗，严重时需就医进行抗组胺治疗。
甲亢急性发作期或需进行放射性碘治疗的患者应避免碘酊消毒。过量碘摄入可能干扰甲状腺功能检测结果，影响治疗方案制定。此类人群可选择氯己定、双氧水等不含碘的消毒产品。
口腔、会阴等黏膜组织禁用碘酊。黏膜对碘的吸收率是皮肤的6-8倍，易导致碘中毒。黏膜消毒推荐使用0.05%碘伏溶液，其刺激性较小且不易被黏膜大量吸收。
新生儿皮肤屏障功能未完善，妊娠期妇女甲状腺代谢活跃，肾功能不全者碘排泄障碍，这三类人群均需严格控制碘暴露。婴幼儿可采用75%酒精棉片擦拭，肾功能不全者宜选用季铵盐类消毒剂。
使用碘酊消毒时应注意避开眼周，金属器械消毒后需彻底冲洗以防腐蚀。日常小伤口处理可优先考虑碘伏棉签，其浓度适中且不含酒精。储存时应密封避光，避免与红药水混用产生有毒碘化汞。出现消毒部位持续红肿、灼痛等异常反应时，应及时就医评估是否出现化学性灼伤或过敏反应。
