甲状腺功能减退症通常需要长期服药，不吃药可能导致病情加重。甲减患者若未经规范治疗，可能引发心血管疾病、代谢紊乱等并发症，但也存在极少数暂时性甲减可能无须终身用药的情况。
原发性甲减患者由于甲状腺激素合成不足，需持续补充左甲状腺素钠片如优甲乐、雷替斯等进行替代治疗。这类患者若擅自停药，会出现畏寒、乏力、水肿等低代谢症状，严重时可诱发黏液性水肿昏迷。妊娠期甲减患者必须严格用药，否则可能影响胎儿神经发育。
亚临床甲减或术后暂时性甲减患者，在促甲状腺激素轻度升高且无典型症状时，部分病例可先通过监测甲状腺功能决定是否用药。桥本甲状腺炎早期出现的短暂甲状腺毒症期过后，也可能出现暂时性激素水平恢复，但需每3个月复查甲状腺功能指标。
甲减患者日常需保证碘和硒的适量摄入，可食用海带、牡蛎等富含微量元素的食物。应注意避免大量进食卷心菜、木薯等可能干扰甲状腺功能的食物，规律作息并定期复查甲状腺功能，任何用药调整都需在内分泌科医生指导下进行。
