从目前来看，大部分新冠肺炎的患者预后良好，没有后遗症，少数患者病情危重，可能会遗留后遗症，在我国80%以上的患者是轻型和普通型，恢复速度比较快，不会留下后遗症，患者肺功能可能轻微的损害，但没有持续残留的肺功能的问题，很少有功能障碍的现象，随着时间的延长，大部分都完全痊愈了，没有任何的后遗症。
但是，新冠肺炎大概还有20%左右的病人会转成重症，有10%-15%左右的病人会因大白肺，而出现急性呼吸窘迫综合征，经过治疗后，可能会出现一定程度的肺间质纤维化，对肺功能有一定的影响，尤其是老年患者，长期抽烟者，还有一些本身有肺部基础疾病的人。另外，有专家指出，新冠病毒除了攻击人体的肺部之外，对男性患者的肾脏和睾丸，也容易受到入侵，可能会导致男性生殖功能的障碍，新冠肺炎治愈患者在备孕前，建议先进行精液的检查。
