甲硝唑含漱液主要适用于治疗口腔厌氧菌感染引起的疾病，包括牙龈炎、牙周炎、冠周炎等，也可用于口腔溃疡的辅助治疗。
牙龈炎通常由牙菌斑堆积引发厌氧菌感染，表现为牙龈红肿、出血。甲硝唑含漱液能抑制牙龈卟啉单胞菌等厌氧菌繁殖，配合机械清除菌斑效果更佳。用药期间可能出现口腔黏膜刺痛感，一般无须停药。不建议儿童及孕妇擅自使用。
牙周炎多伴牙龈退缩、牙周袋形成，甲硝唑含漱液可辅助控制牙周袋内厌氧菌，常与龈下刮治联合应用。需注意长期使用可能引发味觉异常或舌苔染色，用药后建议清水漱口。
智齿萌出不全时易发生冠周软组织感染，甲硝唑含漱液能缓解局部化脓性炎症。急性期需配合全身抗生素治疗，含漱时重点冲洗盲袋区域，每日3次为宜。
对于合并厌氧菌感染的复发性口腔溃疡，甲硝唑含漱液可减轻溃疡面渗出和疼痛。但单纯疱疹或创伤性溃疡无明显效果，建议配合维生素B2辅助修复黏膜。
拔牙创口继发感染时，甲硝唑含漱液能预防干槽症发生。需术后24小时开始使用，避免用力漱口导致血凝块脱落。合并发热等全身症状时应及时就医。
使用甲硝唑含漱液前需摇匀药液，每次含漱3-5分钟后吐出，用药期间禁酒。治疗牙龈炎时可配合巴氏刷牙法清洁牙颈部，牙周炎患者建议使用牙间隙刷清除邻面菌斑。若用药7天症状未缓解，需口腔科复查调整治疗方案。日常注意补充维生素C增强牙龈抵抗力，定期洁牙维护口腔卫生。
