林奇综合征主要通过基因检测和临床筛查相结合的方式诊断。诊断流程包括家族史评估、免疫组化检测、微卫星不稳定性分析以及基因测序等步骤。
家族史评估是初步筛查的重要环节。医生会详细询问患者三代以内直系亲属的肿瘤病史，重点关注结直肠癌、子宫内膜癌等林奇综合征相关肿瘤的发病年龄和类型。符合阿姆斯特丹标准或修订版贝塞斯达指南的家族史特征时，需进一步检测。
免疫组化检测可发现错配修复蛋白缺失。通过肿瘤组织标本检测MLH1、MSH2、MSH6和PMS2四种错配修复蛋白的表达情况。若某种蛋白完全缺失，提示可能存在相应基因的致病突变。
微卫星不稳定性检测是重要辅助手段。采用PCR方法检测肿瘤组织中特定微卫星位点的稳定性，高微卫星不稳定性肿瘤中约15%与林奇综合征相关。该检测对筛查具有较高敏感性。
基因测序是确诊的金标准。对MLH1、MSH2、MSH6、PMS2和EPCAM等基因进行测序分析，明确是否存在致病性突变。二代测序技术可提高检测效率和准确性，必要时需结合多重连接探针扩增技术检测大片段缺失。
对于疑似患者，建议到遗传咨询门诊进行系统评估。诊断过程中可能需要多次采集血液或组织样本，部分情况下需对先证者家属进行级联检测以明确遗传模式。确诊患者应制定定期肿瘤筛查方案。
