甲减多数情况下需要终身服药，仅在部分可逆性病因导致的暂时性甲减中可能无须长期用药。
甲状腺功能减退症若由桥本甲状腺炎、甲状腺手术切除或放射性碘治疗引起，通常意味着甲状腺组织已发生不可逆损伤，无法自行恢复分泌足量甲状腺激素的功能，此时患者必须通过外源性补充左甲状腺素钠片等药物来维持机体正常代谢，停药会导致症状复发甚至出现黏液性水肿昏迷等严重后果。这类情况占据了临床甲减患者的绝大多数，因此医生通常会建议此类人群做好长期乃至终身服药的心理准备和生活规划。相反，如果甲减是由亚急性甲状腺炎恢复期、产后甲状腺炎、某些药物影响或碘摄入异常等暂时性因素诱发，随着原发病因的消除或身体自我调节功能的恢复，甲状腺功能有望恢复正常，这部分患者在医生指导下经过一段时间的药物治疗和严密监测后，可以尝试逐渐减量直至停药，但这需要经过专业的评估确认甲状腺功能已完全稳定，切勿自行判断停药。
确诊甲减的患者应严格遵医嘱规律服用药物，不可随意增减剂量或中断治疗，同时保持均衡饮食，适量摄入富含优质蛋白和维生素的食物，避免过度食用影响甲状腺激素合成的致甲状腺肿物质，定期进行甲状腺功能复查以调整用药方案，并注意保暖、适度运动以改善代谢状态，若有备孕计划需提前咨询医生优化甲状腺功能指标。
