碳酸氢钠不宜与酸性药物、含金属离子药物、四环素类抗生素、铁剂及部分心血管药物合用，可能降低药效或增加不良反应风险。

碳酸氢钠为碱性制剂，与阿司匹林、维生素C等酸性药物联用会发生中和反应，导致两者药效同时减弱。胃酸分泌抑制剂如奥美拉唑合用可能加重碱中毒风险。

碱性环境易使铝、镁、钙等金属离子形成不溶性沉淀。含铝的胃黏膜保护剂如硫糖铝、补钙制剂如碳酸钙与碳酸氢钠同服时吸收率下降50%以上。

多西环素、米诺环素等抗生素在pH＞7环境下溶解度降低，与碳酸氢钠合用可使血药浓度下降30%-40%，影响抗感染效果。

琥珀酸亚铁、多糖铁复合物在碱性环境中转化为难吸收的三价铁。建议间隔2小时以上服用，否则铁吸收率可能从20%降至5%。

地高辛在碱性尿中排泄减慢易蓄积中毒，奎尼丁生物利用度提高可能导致心律失常。合用时应监测血药浓度，调整给药间隔。

服用碳酸氢钠期间需避免同时摄入柑橘类水果及酸奶等酸性食物，建议用药间隔2小时以上。长期大剂量使用可能干扰钙磷代谢，需定期检测电解质水平。运动后大量出汗时慎用，以防加重电解质紊乱。出现肌肉震颤、头痛等碱中毒症状应立即就医。