直肠绒毛状腺瘤的治疗以手术切除为主。该疾病属于癌前病变，治疗方案需根据腺瘤大小、位置及病理特征综合制定，主要干预方式包括内镜下切除、经肛门局部切除和经腹手术。
内镜下黏膜切除术适用于直径小于2厘米、基底较窄的腺瘤。通过结肠镜引导，可完整切除病灶并保留直肠功能，术后需定期复查肠镜监测复发。高频电切圈套器或黏膜下注射辅助技术能提高切除安全性。
经肛门局部切除术适合距肛缘8厘米以内的较大腺瘤。采用经肛门内镜显微手术或传统器械切除，术中需确保切缘阴性。对于广基型腺瘤或伴有高级别上皮内瘤变者，可能需要扩大切除范围。
经腹手术适用于无法通过微创方式处理的复杂病例。包括直肠前切除术或全直肠系膜切除术，特别是对于疑似癌变或多次复发患者。手术方式选择需结合术中快速病理结果调整。
术后需每3-6个月进行肠镜随访，持续2年以上。日常需增加膳食纤维摄入，限制红肉及加工肉制品。腺瘤直径超过3厘米或伴有高级别异型增生时，建议缩短复查间隔至3个月。
