卫生宝丸具有解表祛暑、化湿止泻等作用，主要适用于暑湿感冒、胃肠型感冒、急性胃肠炎等疾病引起的头痛发热、腹痛泄泻等症状。其适用人群可分为暑湿感冒患者、饮食不洁者、寒湿侵袭者、抵抗力低下者及需防暑保健者五类。
卫生宝丸能缓解暑湿感冒引起的头晕头痛、身热烦渴。夏季高温潮湿环境下，患者可能出现恶心呕吐、四肢困重等症状。该药含广藿香、紫苏叶等成分，可配合感冒清热颗粒、藿香正气软胶囊使用。孕妇及阴虚火旺者慎用。
进食腐败变质食物后出现腹痛腹泻时，卫生宝丸中的苍术、陈皮等成分可帮助化湿止泻。常伴有食欲减退、脘腹胀满，需配合蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊调节肠道菌群。服药期间应禁食生冷油腻。
突受雨淋或空调直吹后出现恶寒发热、肠鸣泄泻，属于寒湿型胃肠感冒。该药含白芷、茯苓等温中散寒成分，可与附子理中丸联合使用。若出现水样便且每日超过5次，应及时补液防止脱水。
老人、儿童等群体在季节交替时易被湿邪侵袭。卫生宝丸作为预防性用药，可减轻空调环境下出现的鼻塞流涕症状。但免疫功能缺陷者需在医生指导下使用，避免与免疫抑制剂同服。
高温作业人群可备作防暑药物，对轻症中暑所致的头晕胸闷有效。但出现高热抽搐等重症中暑症状时，应立即采取物理降温并送医。该药不能替代补盐液等电解质补充剂。
服用卫生宝丸期间应保持清淡饮食，避免与辛辣刺激食物同食。用药3天后若症状未缓解或出现皮疹等过敏反应需停药就医。慢性腹泻患者使用前应排除炎症性肠病等器质性疾病。日常需注意食品卫生，空调温度不宜过低，外出时可随身携带预防性药物。
