治疗小儿咳嗽的用药需要在遵医嘱的情况下，对症用药。较为常见的有如盐酸氨溴索以化痰、阿奇霉素等以抗菌，以及小儿肺热咳喘口服液等中成药以清热、解毒、抗病毒。
功能主治：清热解毒，宣肺化痰，用于热邪犯于肺卫所致发热汗出，微恶风寒，咳嗽，痰黄，或兼喘息，口干而渴。
用法用量：口服，1岁至3岁每次10毫升，一日3次;4岁至7岁每次10毫升，一日4次;8岁至...
临床上，若小儿出现咳嗽的同时伴有痰咳出的症状，医生可能会给予如盐酸氨溴索等的祛痰药物，以达到祛痰止咳的目的。若小儿明确由细菌或肺炎支原体、衣原体感染导致的疾病，从而出现咳嗽等症状，可能会通过给予阿奇霉素等药物，以达到抗菌、消炎，从而止咳的目的。
此外，小儿出现咳嗽症状时，多数是由病毒感染引起，包括鼻病毒、腺病毒、流感和副流感病毒，另有10%的上感由细菌引起。家长可在遵医嘱的情况下，通过服用如小儿肺热咳喘口服液等的药物，达到治疗目的。临床常用的小儿肺热咳喘口服液是由麻黄、金银花、板蓝根、黄芩、苦杏仁等11种中药材组成，具有治咳嗽、抗病毒的功效，可改善病毒或细菌引起的咳嗽、痰多、痰黄等症状；其中的麦冬、知母，还能够滋阴润肺，防治孩子燥咳伤肺。该药物组成源自《伤寒杂病论》中的经典组方，麻杏石甘汤和白虎汤，是一款强力抗病毒的儿童止咳药，也是《儿童咳嗽中西医结合诊治专家共识》的推荐用药。
