一般情况下，肛门有一侧肉肿起很疼可能是痔疮、肛周脓肿、肛门息肉等情况导致的，具体分析如下：
1.痔疮：痔疮是肛门处皮下血管充血肿大、瘀血从而形成的肿块，多是便秘、久坐不动、经常进食辛辣食物导致的，通常表现为大便出血、疼痛等症状。患者可以遵医嘱使用马应龙麝香痔疮膏、等清热消肿的药物进行治疗。
2.肛周脓肿：肛周脓肿是肛门周围软组织出现急性感染形成囊肿，主要表现为肛门周围红肿，并伴随疼痛的症状，患者可以遵医嘱服用甲硝唑片、替硝唑胶囊等药物进行治疗。
3.肛门息肉：肛门息肉多是在粪便刺激下引起的良性肿瘤，当大便时，可能会被粪便牵拉至肛门处，一般表现为疼痛症状。患者可以在医生指导下通过手术切除息肉，能够改善症状。
除以上相对常见原因外，还有其他可能性，如皮脂腺囊肿，建议患者及时就诊，查明病因后进行对症治疗。
